More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2835 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
270 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
261 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.82 
 
 
261 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
262 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
263 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
262 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
266 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
260 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.33 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
271 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
273 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
264 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
273 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.21 
 
 
261 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
280 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.14 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.06 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
261 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
259 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
256 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
259 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
259 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.73 
 
 
659 aa  125  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
261 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
264 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
263 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 
255 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
261 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
259 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
259 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
259 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
276 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
270 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
264 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
270 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
263 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
262 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
264 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 
263 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
256 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
266 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  37.99 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
264 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
260 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
259 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
254 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>