47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2249 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  52.78 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  50.92 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  45.69 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  43.76 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  43.93 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  41.86 
 
 		 429 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  41.07 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  43.08 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  39.87 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  36.02 
 
 		 431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  33.72 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  32.79 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  32.25 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  30.04 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  29.98 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  28.33 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  27.36 
 
 		 477 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  27.33 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  27.96 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  28.36 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  38.03 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  36.81 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  32.19 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  30.77 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  35.66 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  35.09 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  34.56 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  29.17 
 
 		 666 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  33.57 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  36.36 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  32.99 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  29.32 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  29.32 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  28.46 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  28.26 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  24.82 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  23.84 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  29.22 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  29.56 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  26.43 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  26.43 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  31.65 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  43.33 
 
 		 562 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  31.01 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>