More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1928 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  100 
 
 		 459 aa  947    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  65.27 
 
 		 463 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  61.73 
 
 		 460 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  61.28 
 
 		 460 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  62.17 
 
 		 468 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  56.4 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  57.43 
 
 		 459 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  56.18 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  56.18 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  54.89 
 
 		 455 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  53.12 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  54.61 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  57.3 
 
 		 449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  51.32 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  51.79 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  50.89 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  51.21 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  51 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  51.15 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  49.56 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  49.56 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  50.44 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  50.88 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  47.51 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  44.47 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  49.55 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  43.79 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  43.36 
 
 		 457 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  42.79 
 
 		 467 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  44.35 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  45.15 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  43.12 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  41.74 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  44.02 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  42.92 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  42.45 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.45 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  44.67 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  41.37 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  42.83 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.18 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.35 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  42.01 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  41.91 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  43.27 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  42.47 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  43.27 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  41.28 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  43.04 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  44.47 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.83 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  41.57 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.85 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  45.74 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  40.93 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  41.8 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  43.27 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  43.27 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  44.03 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.06 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.99 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  42.79 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.61 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.48 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  40.27 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  45.07 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.61 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  40.22 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.16 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  43.43 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  43.65 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  40.45 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.45 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.62 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  41.65 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  40.72 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.81 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  41.43 
 
 		 469 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  40.89 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  40.85 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.45 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.99 
 
 		 467 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  42.98 
 
 		 465 aa  355  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 458 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  40.31 
 
 		 466 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  40.31 
 
 		 466 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  40.09 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  40.76 
 
 		 466 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  40.76 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  40.76 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  39.91 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>