67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02218 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  58.43 
 
 
179 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  58.33 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  59.24 
 
 
179 aa  191  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  59.24 
 
 
179 aa  191  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  60.39 
 
 
174 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  53.8 
 
 
173 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  46.77 
 
 
176 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  49.68 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  49.68 
 
 
176 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  49.68 
 
 
176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  39.88 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  38.73 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  38.73 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  38.15 
 
 
178 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  35.62 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  54.1 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  30.43 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  29.57 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  32.79 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  34.67 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  30.07 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  29.01 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.43 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.12 
 
 
171 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.12 
 
 
171 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.12 
 
 
171 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  30 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  30 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  34.83 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  30 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  29.27 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  29.27 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  30.77 
 
 
187 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  27.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  26.99 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  26.99 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  26.99 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  26.99 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  27.93 
 
 
175 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  28.1 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  28.1 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  28.1 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  27.27 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  28.1 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  28.1 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  27.81 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  27.14 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  27.14 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  26.77 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  31.2 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  28 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  27.17 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  27.17 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  27.17 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  23.81 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  29.03 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>