185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01609 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  355  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  99.42 
 
 		 199 aa  352  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  97.08 
 
 		 199 aa  347  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  96.49 
 
 		 199 aa  345  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  82.25 
 
 		 199 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  81.66 
 
 		 199 aa  290  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  81.66 
 
 		 199 aa  290  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  81.66 
 
 		 199 aa  290  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  81.66 
 
 		 199 aa  290  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 206 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 206 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 247 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  43.29 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 311 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  42.69 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  40.96 
 
 		 193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  37.87 
 
 		 209 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  42.5 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  42.01 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 198 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 198 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 195 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 202 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  41.42 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 209 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 222 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 212 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  32.7 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 212 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 212 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.19 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  31.06 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  29.03 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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