More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  100 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.77 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  39.93 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.39 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  36.21 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  36.84 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  34.43 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.96 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.98 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  37.26 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  34.88 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.66 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.03 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  34.71 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  34.7 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  33.12 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  39.06 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  36.96 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  37.1 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.77 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  33.44 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  36.18 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  40.78 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  35 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  35.69 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  34.57 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  35.65 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  36.33 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  37.46 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.93 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  34 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  34.84 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  36.19 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  34.19 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  37.46 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  32.67 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  36.05 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  35.28 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.99 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  34.48 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  35.6 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  32 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.02 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  33.66 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  41.31 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  34.01 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.78 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  34.92 
 
 		 327 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  36.53 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  36.53 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  36.53 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  34.31 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.88 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  36.07 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  33.33 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  36.53 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.9 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.93 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  36.16 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  28.66 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  34.43 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  41.83 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.43 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  33.95 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  30.61 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  32.59 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  31.49 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  36.08 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  31.85 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  33.87 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  30.03 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  27.81 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  31.91 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  33.33 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.09 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  28.9 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  31.49 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  34.98 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>