More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31690 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31690  Sigma54 -dependent activator protein  100 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5217  sigma-54-binding protein  70.78 
 
 
316 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0327  sigma-54 factor, interaction region  70.78 
 
 
316 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.768789  normal  0.257375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5166  sigma-54 dependent transcriptional regulator  73.53 
 
 
276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0299  putative sigma54 specific transcriptional regulator  72.63 
 
 
276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5223  putative sigma54 specific transcriptional regulator  73.43 
 
 
276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5073  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  73.53 
 
 
276 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0222  response regulator receiver domain-containing protein  76.3 
 
 
310 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.641426  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1175  transcriptional regulator  74.14 
 
 
324 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13000  transcriptional regulator  73.38 
 
 
324 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.597599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4342  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  71.21 
 
 
276 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0564  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.83 
 
 
391 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3328  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
352 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34150  putative transcriptional regulator  55.73 
 
 
361 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.093709  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2903  putative transcriptional regulator  55.73 
 
 
361 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1567  sigma-54 factor, interaction region  52.06 
 
 
381 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0116194  hitchhiker  0.0000311693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3467  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  53.73 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7716  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.75 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.416499  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3248  helix-turn-helix, Fis-type  53.73 
 
 
368 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43900  Sigma54-dependent transcriptional activator protein  52.65 
 
 
367 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2908  putative transcriptional regulator  51.8 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34210  putative transcriptional regulator  53.03 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0247085  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6033  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.68 
 
 
376 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2771  sigma-54 dependent transcriptional regulator  50.52 
 
 
367 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2982  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.52 
 
 
367 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0881  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.22 
 
 
373 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.588109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  53.03 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332569  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3918  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.14 
 
 
367 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84668  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0556  response regulator receiver protein  52.67 
 
 
367 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5803  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54.48 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2612  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.99 
 
 
372 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22350  sigma54-dependent activator protein  55.08 
 
 
343 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3993  putative sigma54 specific transcriptional regulator  52.99 
 
 
375 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  0.104831 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6136  putative sigma54 specific transcriptional regulator  56.05 
 
 
389 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0424882  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5791  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.49 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6156  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.49 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164312  normal  0.688082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6636  putative sigma54 specific transcriptional regulator  51.12 
 
 
375 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3526  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.54 
 
 
377 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0775  helix-turn-helix, Fis-type  41.35 
 
 
457 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  54.21 
 
 
481 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.481364  normal  0.940549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.01 
 
 
460 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1472  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.91 
 
 
451 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0540  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.88 
 
 
445 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0143  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.34 
 
 
449 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3191  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.31 
 
 
553 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.09 
 
 
462 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2085  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.86 
 
 
453 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  49.35 
 
 
453 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3749  Sigma 54 interacting domain protein  42.26 
 
 
596 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552068  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1248  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.8 
 
 
373 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.81595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1292  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.98 
 
 
466 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003503  sigma-54 dependent response regulator  44.2 
 
 
483 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4456  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.37 
 
 
457 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.3 
 
 
455 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4088  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  46.37 
 
 
457 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.0065577  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3981  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.57 
 
 
433 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0890  putative sigma54 specific transcriptional regulator  46.84 
 
 
543 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.35 
 
 
459 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.402822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0300  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.41 
 
 
457 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.61 
 
 
459 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.38 
 
 
512 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2897  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45 
 
 
473 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02265  hypothetical protein  44 
 
 
483 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1129  sigma-54 dependent response regulator  39.12 
 
 
484 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2092  NifA subfamily transcriptional regulator  44.07 
 
 
606 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0489  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.32 
 
 
473 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4836  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.73 
 
 
456 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.23 
 
 
454 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3193  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.53 
 
 
456 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.98 
 
 
486 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  42.41 
 
 
445 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.08 
 
 
453 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0965  two-component response regulator PilR  43.56 
 
 
446 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.25964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1534  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.31 
 
 
463 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  46.19 
 
 
472 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.23 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3375  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.17 
 
 
461 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50180  two-component response regulator  45.67 
 
 
473 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2227  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.22 
 
 
608 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.025766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2137  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.22 
 
 
608 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.09 
 
 
472 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0168  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.04 
 
 
462 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2730  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.49 
 
 
535 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.928628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0917  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.26 
 
 
568 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1711  NifA subfamily transcriptional regulator  43.22 
 
 
608 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.478536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0687  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.88 
 
 
459 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.73 
 
 
510 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02702  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.98 
 
 
592 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02664  hypothetical protein  41.98 
 
 
592 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2309  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  47.66 
 
 
513 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00141019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2160  two component signal transduction response regulator  46.93 
 
 
451 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000278347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0823  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.98 
 
 
592 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.98 
 
 
592 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0839  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.98 
 
 
592 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.08 
 
 
464 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.46 
 
 
455 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4159  sigma-54 dependent transcriptional regulator, Fis family  41.98 
 
 
592 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.778459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.06 
 
 
458 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  40.78 
 
 
486 aa  199  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3916  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  41.41 
 
 
462 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000203856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>