More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29500 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  837    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  32.22 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  33.41 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  32.22 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  30.88 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  30.88 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.4 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.4 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  28.14 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.46 
 
 		 400 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  28.1 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  29.51 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.87 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.04 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 475 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  36.36 
 
 		 716 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 475 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 475 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 475 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 475 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  33.61 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  34.66 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  31.09 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  30.16 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.41 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  29.16 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.3 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  30.86 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 830 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.58 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.06 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.62 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.42 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.71 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0497  hypothetical protein  28.44 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  25.72 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  25.7 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.06 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.38 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  23.73 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.38 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.38 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  25.41 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.83 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  27.58 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  24.05 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  22.85 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.38 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2003  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.71 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0260565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.73 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.39 
 
 		 851 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.74 
 
 		 836 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  22.69 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.26 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.46 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.71 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.24 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4079  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  26.85 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 852 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4046  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 930 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  34.71 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.1 
 
 		 842 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3937  hypothetical protein  27.49 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 849 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1633  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.95 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  30.04 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.14 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.45 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.58 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 857 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  31.1 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  27.68 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.18 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1620  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.1 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2529  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  24.1 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 853 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2483  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.1 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00147297  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.1 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0067716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.1 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00286068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>