261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  100 
 
 
363 aa  740    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  59.38 
 
 
391 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  52.34 
 
 
394 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  51.1 
 
 
390 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  53.7 
 
 
388 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  52.6 
 
 
388 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  51.67 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  51.67 
 
 
376 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  50 
 
 
380 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  50 
 
 
376 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  45.75 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  45.75 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  44.35 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  44.35 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  44.35 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  44.38 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  43.53 
 
 
414 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  43.53 
 
 
415 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  43.25 
 
 
415 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  43.49 
 
 
391 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  43.49 
 
 
391 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  43.49 
 
 
411 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  43.21 
 
 
391 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  43.49 
 
 
411 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  43.49 
 
 
411 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  43.49 
 
 
411 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  43.21 
 
 
411 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  43.25 
 
 
414 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  37.19 
 
 
376 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  38.08 
 
 
373 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  37.29 
 
 
372 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  38.19 
 
 
375 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  36.81 
 
 
370 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  33.7 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  33.7 
 
 
355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.24 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  35.92 
 
 
412 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  32.96 
 
 
354 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  33.15 
 
 
355 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  32.6 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  35.86 
 
 
351 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
352 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.87 
 
 
355 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  32.32 
 
 
355 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  34.9 
 
 
353 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  35.28 
 
 
348 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  32.32 
 
 
353 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  33.78 
 
 
384 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  33.77 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  32.55 
 
 
374 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 
349 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 
354 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  33.24 
 
 
372 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  34.56 
 
 
350 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  34.3 
 
 
418 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 
350 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  35.07 
 
 
351 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  35.89 
 
 
345 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  33.8 
 
 
410 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
414 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
404 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.16 
 
 
412 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
376 aa  165  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  29.09 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  32.46 
 
 
412 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  33.8 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  32.68 
 
 
410 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  32.62 
 
 
351 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  28.41 
 
 
339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.52 
 
 
379 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  32.07 
 
 
354 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  28.33 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  32.8 
 
 
369 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  31.68 
 
 
381 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  32.13 
 
 
367 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.01 
 
 
340 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  31.07 
 
 
328 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.06 
 
 
342 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  30.06 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.24 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  33.43 
 
 
375 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.43 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  28.86 
 
 
342 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.04 
 
 
361 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  28.22 
 
 
386 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  30.37 
 
 
359 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
386 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  33.23 
 
 
363 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  29.81 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  27.58 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  32.64 
 
 
363 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  30.67 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  28.77 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  32.84 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  30.51 
 
 
342 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.11 
 
 
338 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  31.23 
 
 
352 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>