133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18650 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  75.71 
 
 
144 aa  229  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  77.3 
 
 
143 aa  226  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  74.47 
 
 
209 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  71.63 
 
 
143 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  74.29 
 
 
142 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  68.09 
 
 
143 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
139 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
139 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  65.93 
 
 
139 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  64.66 
 
 
165 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  50.39 
 
 
144 aa  147  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  54.33 
 
 
147 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  51.16 
 
 
138 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  49.25 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 
138 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 
143 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  48.51 
 
 
143 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
161 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 
374 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
139 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  49.25 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  46.88 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  48.51 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  50.41 
 
 
137 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 
134 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  51.3 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  47.24 
 
 
135 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 
136 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  47.15 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  37.6 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  44.7 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  42.11 
 
 
147 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
138 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
138 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  40.74 
 
 
155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  36.8 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  42.03 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  45.31 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  41.67 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  45.83 
 
 
140 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  45.04 
 
 
165 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  45.04 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  45.08 
 
 
140 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  41.67 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
139 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  34.13 
 
 
151 aa  93.2  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  40.95 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  33.6 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  30.97 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  32.2 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  38.2 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  34.12 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  34.83 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  35.34 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  32.18 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  34.12 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  30.83 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  28.79 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  32.95 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  29.57 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  24.03 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.18 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  24.18 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  31.03 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  31.52 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>