259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11530  Cytochrome B561 family protein  100 
 
 
174 aa  332  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  43.02 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  42.29 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  38.29 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  38.29 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  36.99 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  34.3 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  33.52 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  33.52 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  36.21 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  37.14 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.31 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.66 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  33.9 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  32.95 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.99 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  28.64 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  35.03 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  34.68 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.68 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.31 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.59 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  34.09 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  36.84 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  34.1 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.1 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  34.1 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  34.1 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  34.1 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  31.02 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  34.1 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  34.86 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.03 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  34.71 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  32.02 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.95 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.95 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  39.84 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.7 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32.77 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.22 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.95 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.82 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.2 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.76 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  44.83 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  34.64 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.34 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  31.18 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.64 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.64 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.64 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  31.64 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  29.28 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  31.82 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.51 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  27.27 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.16 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.97 
 
 
213 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  29.51 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  33.33 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  28.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  33.15 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  41.86 
 
 
184 aa  61.6  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  34.59 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.24 
 
 
196 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  32.58 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  45.98 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.24 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  33.87 
 
 
406 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.16 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.68 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.96 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  37.01 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.84 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.16 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.16 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.57 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  31.18 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  32.39 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  30.22 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.8 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.9 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  31.28 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  32.2 
 
 
176 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  28.89 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.7 
 
 
190 aa  57.4  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  32.2 
 
 
176 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  29.67 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  26.26 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  28.98 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  30.73 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.33 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.38 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>