59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  33.91 
 
 		 1324 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  33.33 
 
 		 1331 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  100 
 
 		 1367 aa  2706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  33.41 
 
 		 1309 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  31.74 
 
 		 1588 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  31.13 
 
 		 1569 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1542 aa  251  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  26.79 
 
 		 1230 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  33.77 
 
 		 1267 aa  178  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  27.96 
 
 		 1265 aa  172  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  32.21 
 
 		 1164 aa  154  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  31.31 
 
 		 1159 aa  152  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  30.77 
 
 		 1157 aa  146  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  29.57 
 
 		 1140 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  29.57 
 
 		 1157 aa  143  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  29.57 
 
 		 1157 aa  143  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  29.57 
 
 		 1157 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1157 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  29.57 
 
 		 1157 aa  143  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  29.57 
 
 		 1157 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  33.81 
 
 		 1180 aa  139  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  33.81 
 
 		 1172 aa  139  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  33.81 
 
 		 1150 aa  139  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  33.81 
 
 		 1180 aa  139  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  30.52 
 
 		 1271 aa  139  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  33.81 
 
 		 1150 aa  139  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  28.04 
 
 		 1160 aa  135  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  29.43 
 
 		 1172 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  29.1 
 
 		 1172 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  29.16 
 
 		 1297 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  29.16 
 
 		 1297 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  29.07 
 
 		 1186 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  28.85 
 
 		 1315 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  28.53 
 
 		 1315 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1313 aa  126  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1297 aa  126  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  35.32 
 
 		 289 aa  123  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  28.62 
 
 		 1259 aa  122  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  28.1 
 
 		 1244 aa  115  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  27.08 
 
 		 1548 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  27.08 
 
 		 1574 aa  107  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  27.08 
 
 		 1580 aa  107  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1544 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  27.08 
 
 		 1574 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  27.08 
 
 		 1266 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  27.24 
 
 		 1471 aa  105  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  29.06 
 
 		 815 aa  71.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  26.78 
 
 		 603 aa  49.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 465 aa  48.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 		 553 aa  48.5  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 562 aa  48.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 927 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 802 aa  46.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 557 aa  45.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  35.38 
 
 		 564 aa  45.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  29.61 
 
 		 643 aa  45.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 366 aa  45.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1049 aa  45.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.17 
 
 		 292 aa  45.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>