More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  100 
 
 		 147 aa  296  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  76.51 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  65.52 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  60.96 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  60.96 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  56.67 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  56.38 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.38 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  56 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  56 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.73 
 
 		 153 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  56 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.67 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  54 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  46.38 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  46.38 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.29 
 
 		 144 aa  119  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  45.65 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  44.93 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  44.2 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  46.38 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.66 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  44.6 
 
 		 150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  44.29 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.2 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  42.03 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  42.96 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.11 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  39.73 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.26 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  41.67 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  41.67 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  43.57 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  40.88 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.6 
 
 		 173 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.3 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.58 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  40.91 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  40.91 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.29 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  39.85 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  39.85 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.42 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  38.57 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.55 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  39.16 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  40.91 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.52 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.52 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.52 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.52 
 
 		 176 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.92 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  40.6 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.51 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.53 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  43.28 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  43.28 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  33.82 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  39.13 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  39.13 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  34.59 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  37.59 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  33.08 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  44.29 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>