More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 314 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  34.47 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  32.71 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  34.07 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  31.53 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 447 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  30.13 
 
 		 359 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.61 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  28.51 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.1 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.51 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  22.11 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  25.69 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>