More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7593 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 397 aa  810    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  46.63 
 
 		 385 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  46.93 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.55 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  52.54 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  46.65 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  48.07 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.74 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.21 
 
 		 352 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.58 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  42.6 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.68 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.93 
 
 		 361 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 		 392 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  41.89 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  46.23 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  46.23 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2050  ABC transporter-like  44.47 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.75 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  43.65 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.39 
 
 		 385 aa  282  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.09 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  41.71 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  43.42 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  42.11 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  43.88 
 
 		 355 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  42.15 
 
 		 361 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  44.16 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  44.73 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  44.2 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  41.64 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  45.27 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  44.9 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  40.99 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  41.97 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  44.68 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.97 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  42.48 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  42.23 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  45.45 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  41.45 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  45.83 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  41.88 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  48.59 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.47 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  42.55 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.4 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  44.44 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.15 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  43.19 
 
 		 357 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  49.03 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  43.8 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.16 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  44.62 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.6 
 
 		 369 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  44.62 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  40.05 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  40.31 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  43.37 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  44.18 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  44.95 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  48.53 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.68 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  47.31 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  44.18 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  43.51 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  40.11 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  43.88 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5670  ABC transporter related  52.03 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  46.73 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3139  ABC transporter-like protein protein  42.49 
 
 		 427 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  45.05 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  39.95 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  48.93 
 
 		 332 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.68 
 
 		 351 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  52.47 
 
 		 393 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  42.12 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  43.67 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 356 aa  269  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  46.41 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  44.61 
 
 		 332 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 		 359 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  44.48 
 
 		 362 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  44.06 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  42.82 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  43.41 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  42.22 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  47.99 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  41.6 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  48.93 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  42.31 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.35 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  43.58 
 
 		 333 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>