210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5689 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1376    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  48.68 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  43.73 
 
 		 700 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  44.02 
 
 		 700 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  44.63 
 
 		 710 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  42.94 
 
 		 713 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  44.6 
 
 		 719 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  45.86 
 
 		 707 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  43.01 
 
 		 659 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  45.71 
 
 		 707 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  45.71 
 
 		 707 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  43.72 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  41.91 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.27 
 
 		 680 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  39.04 
 
 		 687 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  37.46 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  37.92 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  37.48 
 
 		 695 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  37.34 
 
 		 695 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  39.43 
 
 		 682 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  42.6 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  37.26 
 
 		 698 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  37.09 
 
 		 695 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  38.53 
 
 		 688 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  38.23 
 
 		 695 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.16 
 
 		 680 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  39.04 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.43 
 
 		 670 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.44 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.81 
 
 		 688 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.75 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  40.47 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.18 
 
 		 692 aa  357  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  35.7 
 
 		 681 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.23 
 
 		 697 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  34.76 
 
 		 693 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  34.74 
 
 		 704 aa  317  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  34.27 
 
 		 702 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  33.73 
 
 		 716 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.6 
 
 		 713 aa  300  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.9 
 
 		 749 aa  269  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.83 
 
 		 653 aa  248  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  34.04 
 
 		 639 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.41 
 
 		 676 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 670 aa  161  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.62 
 
 		 676 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  29.8 
 
 		 676 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.14 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.62 
 
 		 726 aa  150  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  24.84 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.13 
 
 		 691 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.95 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.16 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  26.14 
 
 		 733 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.44 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.43 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.23 
 
 		 727 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.1 
 
 		 724 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.29 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  25.83 
 
 		 733 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.4 
 
 		 724 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.23 
 
 		 699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  24.3 
 
 		 736 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  24.7 
 
 		 730 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.95 
 
 		 676 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.43 
 
 		 739 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.64 
 
 		 734 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.28 
 
 		 711 aa  137  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 		 734 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 		 734 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.63 
 
 		 733 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  26.77 
 
 		 731 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  26.58 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  24.9 
 
 		 726 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.79 
 
 		 699 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  43.05 
 
 		 664 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.31 
 
 		 731 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.31 
 
 		 732 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  42.38 
 
 		 664 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  24.61 
 
 		 725 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  24.61 
 
 		 725 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.05 
 
 		 725 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  24.02 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  24.87 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.02 
 
 		 679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.02 
 
 		 679 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  24.02 
 
 		 679 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  24.02 
 
 		 679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>