111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0802 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
405 aa  837    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  40 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
403 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.5 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  27.2 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.61 
 
 
403 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.27 
 
 
403 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.74 
 
 
454 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  37.07 
 
 
334 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  25.5 
 
 
451 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 
353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.7 
 
 
423 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.93 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  34.38 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.77 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  34.87 
 
 
419 aa  117  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.21 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.98 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  37.02 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.17 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.98 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  27.49 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  29.86 
 
 
419 aa  110  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.32 
 
 
354 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.69 
 
 
359 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  34.95 
 
 
342 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  32.02 
 
 
347 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  34.58 
 
 
342 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.24 
 
 
359 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  31.38 
 
 
351 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  29.81 
 
 
355 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.8 
 
 
359 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.77 
 
 
358 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  33 
 
 
352 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.65 
 
 
351 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.29 
 
 
360 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  31.28 
 
 
354 aa  103  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.32 
 
 
334 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  34.88 
 
 
349 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  29.33 
 
 
418 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.38 
 
 
334 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 
342 aa  101  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.96 
 
 
360 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.73 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.5 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.69 
 
 
352 aa  98.2  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  30.84 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  31.4 
 
 
348 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  27.67 
 
 
353 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  28.08 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.94 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  24.37 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  27.09 
 
 
353 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.18 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  28.92 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  26.89 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  24.65 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  24.22 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  24.22 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.31 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  28.33 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.33 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.84 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.84 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  21.28 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
364 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  24.67 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  21.28 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  21.28 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  21.28 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.37 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  23.32 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  24.11 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  24.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.62 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  22.64 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  21.24 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  25.69 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  22.54 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  20.57 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  25.69 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  28.03 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  27.67 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  28.03 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  25.69 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.31 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  23.61 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.68 
 
 
377 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>