More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3956 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0408  major facilitator superfamily MFS_1  89.89 
 
 		 464 aa  789    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3956  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  886    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00119872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  69.79 
 
 		 444 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.51 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 450 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.83 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.82 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.75 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.5 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.82 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.73 
 
 		 433 aa  272  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.85 
 
 		 482 aa  272  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.34 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.58 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 461 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.06 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.91 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.84 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  42.31 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.48 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  39.14 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  41.1 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  40 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.31 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.66 
 
 		 459 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.86 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.03 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.2 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.2 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.2 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 439 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  38.06 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.33 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.16 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  38.46 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.9 
 
 		 439 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 439 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.97 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 439 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  37.38 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 524 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  38.7 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  38.27 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  38.69 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  38.7 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  38.69 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.69 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.74 
 
 		 437 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  38.44 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>