More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3401 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3401  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 277 aa  557  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0637636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  90.19 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.65 
 
 		 608 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  56.08 
 
 		 650 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  51.89 
 
 		 632 aa  249  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 596 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.42 
 
 		 612 aa  222  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  43.89 
 
 		 631 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  40.38 
 
 		 589 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  36 
 
 		 633 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  39.84 
 
 		 612 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.4 
 
 		 641 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.4 
 
 		 650 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.4 
 
 		 650 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 		 634 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  36.51 
 
 		 615 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 604 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  39.57 
 
 		 605 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  43.64 
 
 		 595 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  40.22 
 
 		 607 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  29.58 
 
 		 581 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.17 
 
 		 587 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.23 
 
 		 583 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  30.08 
 
 		 586 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  30.08 
 
 		 586 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  30.08 
 
 		 586 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  30.94 
 
 		 588 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.08 
 
 		 586 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.08 
 
 		 586 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.08 
 
 		 586 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.08 
 
 		 586 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.79 
 
 		 571 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  24.34 
 
 		 582 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  24.71 
 
 		 579 aa  92  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.24 
 
 		 586 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  28.63 
 
 		 584 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  25.31 
 
 		 578 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 		 571 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 		 571 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 		 571 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  26.69 
 
 		 572 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.42 
 
 		 571 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  28.1 
 
 		 589 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  28.87 
 
 		 586 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  28.69 
 
 		 601 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  26.21 
 
 		 572 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 		 608 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 573 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  26.4 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  25.47 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.31 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  26.02 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  25.65 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.88 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  26.02 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  28.4 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.02 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  30.28 
 
 		 588 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.5 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  23.83 
 
 		 870 aa  82.8  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 579 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.01 
 
 		 598 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  26.24 
 
 		 598 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  22.13 
 
 		 598 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.01 
 
 		 598 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  28.14 
 
 		 1230 aa  82  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  25.2 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  29.61 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  25.22 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.75 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  27.42 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  26.91 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  28.11 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  26.95 
 
 		 611 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  30.72 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.42 
 
 		 588 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  28.73 
 
 		 617 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  27.04 
 
 		 566 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  25.37 
 
 		 611 aa  79.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.42 
 
 		 588 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  24.7 
 
 		 615 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  22.9 
 
 		 566 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  26.63 
 
 		 594 aa  79  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.82 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.41 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  27.37 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  29.89 
 
 		 1522 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  26.69 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  23.08 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.88 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  29.5 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.31 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  27.74 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.7 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>