More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2825 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
365 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
327 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
354 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  55.73 
 
 
396 aa  351  8.999999999999999e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.01 
 
 
319 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  55.35 
 
 
325 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.16491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
366 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.186697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.96 
 
 
349 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
312 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
324 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 
299 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1631  ABC transporter, permease protein  42.99 
 
 
312 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0718199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31120  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.85 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
299 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532842  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
310 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
280 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
310 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
310 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
343 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  39.92 
 
 
288 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
303 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.854176  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11308  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppC  37.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
342 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0874815  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
348 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
308 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
280 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
308 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
356 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.302373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
307 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
307 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1253  ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
315 aa  176  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000107069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
285 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
278 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
300 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
285 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  33.66 
 
 
310 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
347 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
426 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2292  putative peptide ABC transporter permease protein  41.08 
 
 
296 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00757502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  31.29 
 
 
300 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
325 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
304 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
349 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
373 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
317 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
313 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  31.94 
 
 
302 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
304 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
338 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
371 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.41 
 
 
284 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
300 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
371 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
285 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  30.97 
 
 
300 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
310 aa  169  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
494 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  34.77 
 
 
341 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
312 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.94 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
355 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.56 
 
 
384 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.86 
 
 
308 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
282 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
334 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.82 
 
 
479 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
331 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
300 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.244803  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
300 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  34.55 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  36.2 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>