More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3944 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.82 
 
 
299 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.1 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0874815  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11308  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppC  77.78 
 
 
291 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1952  oligopeptide ABC transporter, permease protein  59.42 
 
 
279 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.16 
 
 
319 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532842  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.19 
 
 
308 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.85 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.26 
 
 
290 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00191042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.24 
 
 
326 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.854176  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1253  ABC transporter, permease protein  46.81 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000107069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2292  putative peptide ABC transporter permease protein  52.28 
 
 
296 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00757502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
356 aa  232  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.302373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 
300 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  42.28 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  42.28 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
324 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08470  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
338 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  40.81 
 
 
300 aa  211  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
326 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
310 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
304 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 
304 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
319 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1631  ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
312 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0718199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.26 
 
 
396 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
300 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 
300 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
306 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
305 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.79 
 
 
302 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.6 
 
 
300 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  42.6 
 
 
300 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.6 
 
 
300 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
305 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
280 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
302 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31120  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.94 
 
 
323 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.25 
 
 
300 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
327 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.6 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.6 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.6 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.6 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
310 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
282 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
310 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
354 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
296 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
307 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
307 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
280 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.69 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  40.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  40.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
299 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  36.33 
 
 
310 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
293 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
302 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
302 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
308 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.21 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.16491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
314 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
301 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
277 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
349 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
344 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
304 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
343 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
292 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
317 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
327 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  35.48 
 
 
279 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01219  oligopeptide transporter subunit  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1354  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000186421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1414  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.585769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>