More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3807 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.11 
 
 
338 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370514  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1253  ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 
315 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000107069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
356 aa  236  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.302373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
319 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532842  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
299 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1952  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.2 
 
 
279 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
307 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
307 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
307 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
303 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.854176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
308 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11308  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppC  38.28 
 
 
291 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
299 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0874815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
303 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
312 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
290 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00191042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.67 
 
 
396 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
365 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2292  putative peptide ABC transporter permease protein  39.27 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00757502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
324 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08470  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.53 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
280 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
306 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 
304 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31120  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.59 
 
 
323 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1631  ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0718199  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
307 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
304 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
327 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  33.69 
 
 
307 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.69 
 
 
307 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  34.04 
 
 
307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
280 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
307 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
282 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
293 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.97 
 
 
284 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
300 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.02 
 
 
300 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  33.69 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
299 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  30.6 
 
 
310 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  32 
 
 
302 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
317 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
305 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.52 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
308 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  31.27 
 
 
300 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
338 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
350 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.9 
 
 
293 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.39 
 
 
308 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
321 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
361 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  30.91 
 
 
300 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.67 
 
 
325 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.16491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
300 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
305 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
299 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.65 
 
 
302 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
285 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
348 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  33.09 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
274 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.09 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.09 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.09 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0725  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
301 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
316 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  32.73 
 
 
300 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
300 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  32.73 
 
 
300 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0567  oligopeptide ABC transporter, permease  30.59 
 
 
301 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>