More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2964 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
361 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.21 
 
 
331 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.85 
 
 
327 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55 
 
 
348 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
325 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
347 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.57 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000165422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
310 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.55 
 
 
310 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
340 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
313 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
338 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
314 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
356 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
356 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.57 
 
 
293 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.67 
 
 
302 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
338 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  42.54 
 
 
338 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
338 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
299 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  45.39 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1302  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  45.05 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1103  oligopeptide ABC transporter permease  42.82 
 
 
338 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1079  oligopeptide ABC transporter, permease  42.82 
 
 
338 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1193  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.82 
 
 
338 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0326029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1340  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.82 
 
 
338 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.25 
 
 
338 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 
320 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
340 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 
300 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  43.12 
 
 
300 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
301 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
305 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
318 aa  230  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
318 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
304 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
302 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
334 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
280 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
319 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0184678  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  42.03 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  42.03 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
280 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  42.03 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.03 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
308 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  42.03 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
301 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
274 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
309 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
305 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  36 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  42.38 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.38 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
301 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
310 aa  220  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
300 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0211  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5113  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
334 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  37.11 
 
 
341 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
293 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.72 
 
 
337 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
307 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
307 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 
304 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  41.86 
 
 
304 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  39.6 
 
 
307 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.59 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
289 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
302 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.07 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  39.26 
 
 
307 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.26 
 
 
307 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>