More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1614 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
340 aa  685    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.35 
 
 
340 aa  591  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.64 
 
 
338 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.13 
 
 
338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1302  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.17 
 
 
338 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1103  oligopeptide ABC transporter permease  71.17 
 
 
338 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  70.87 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.77 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1079  oligopeptide ABC transporter, permease  71.17 
 
 
338 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.77 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1193  oligopeptide ABC transporter permease protein  71.17 
 
 
338 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0326029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  70.87 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1340  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.17 
 
 
338 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.81 
 
 
356 aa  407  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.81 
 
 
356 aa  407  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
313 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 
314 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
310 aa  325  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
310 aa  325  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
313 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
325 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
309 aa  262  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  43.47 
 
 
341 aa  261  8.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.87 
 
 
320 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
321 aa  259  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0150  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.29 
 
 
343 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
347 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.46 
 
 
337 aa  257  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
331 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
361 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.41 
 
 
293 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.05 
 
 
282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.86 
 
 
302 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
301 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0392  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.48 
 
 
343 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.41 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
377 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 
386 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  38.54 
 
 
302 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
299 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  39.05 
 
 
300 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
379 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  37.86 
 
 
349 aa  226  3e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
318 aa  227  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  38.58 
 
 
334 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.58 
 
 
334 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
334 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
334 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0211  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
334 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
334 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5113  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
334 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  37.17 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  37.46 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.91 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.46 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.46 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.46 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000165422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
317 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
308 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
379 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
297 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.57 
 
 
301 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
334 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
300 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  36.1 
 
 
379 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
379 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  36.88 
 
 
304 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.06 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
300 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
300 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0177  oligopeptide ABC transporter, permease  48.91 
 
 
334 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
313 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0174  oligopeptide ABC transporter, permease  48.91 
 
 
334 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175997  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
310 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
300 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.407507  hitchhiker  0.0072251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
302 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
305 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
293 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
307 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
307 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
296 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
302 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1731  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  38.05 
 
 
301 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1425  normal  0.136954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
302 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  38.05 
 
 
302 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
302 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>