More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3855 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.03 
 
 
321 aa  408  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
338 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.43 
 
 
340 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
314 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  44.82 
 
 
338 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
338 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.82 
 
 
338 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1103  oligopeptide ABC transporter permease  45.12 
 
 
338 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1079  oligopeptide ABC transporter, permease  45.12 
 
 
338 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1193  oligopeptide ABC transporter permease protein  45.12 
 
 
338 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0326029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1340  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.12 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1302  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.82 
 
 
338 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.82 
 
 
338 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.82 
 
 
338 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
356 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
356 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 
313 aa  249  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
340 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.92 
 
 
293 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
348 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
347 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
313 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
361 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
299 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.46 
 
 
302 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.24 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0392  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.46 
 
 
343 aa  212  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  38.28 
 
 
341 aa  209  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
304 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
300 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.407507  hitchhiker  0.0072251 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
318 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  37.58 
 
 
349 aa  206  5e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
293 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
300 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
297 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
307 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
307 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
296 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
305 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  37.33 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.52 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 
300 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  36.99 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0150  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
299 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  37.88 
 
 
302 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
305 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
341 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000165422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  36.9 
 
 
300 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
289 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
290 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.614424  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
318 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.54 
 
 
302 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
308 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.54 
 
 
302 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  37.54 
 
 
302 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  37.54 
 
 
302 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0184678  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
302 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
302 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
386 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.26 
 
 
308 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
299 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
377 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
270 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
379 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
301 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  42.53 
 
 
473 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
299 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
386 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
494 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
485 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
495 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
309 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01219  oligopeptide transporter subunit  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1731  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  36.9 
 
 
301 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1425  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1354  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
497 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1393  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
302 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
302 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0767914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1414  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  36.9 
 
 
302 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.585769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1895  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  36.9 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.213821  normal  0.110744 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.51 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
496 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  42.08 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>