More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01219 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01219  oligopeptide transporter subunit  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1731  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1425  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1354  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000186421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1393  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1895  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  99.67 
 
 
301 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.213821  normal  0.110744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1414  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  99.34 
 
 
302 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.585769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  96.03 
 
 
302 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  96.03 
 
 
302 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  96.03 
 
 
302 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  96.03 
 
 
302 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  95.7 
 
 
302 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.72 
 
 
302 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.7 
 
 
302 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2161  oligopeptide transport system permease  92.36 
 
 
301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00516752  normal  0.0301341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.36 
 
 
301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1958  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  92.36 
 
 
301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.75 
 
 
302 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.09 
 
 
302 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.41 
 
 
302 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0767914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.74 
 
 
302 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  68.87 
 
 
300 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  67.88 
 
 
300 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  69.21 
 
 
302 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  69.21 
 
 
300 aa  431  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.88 
 
 
308 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.85 
 
 
301 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  58.58 
 
 
310 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60 
 
 
302 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 
299 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.37 
 
 
307 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.37 
 
 
307 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
317 aa  342  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  54.55 
 
 
308 aa  341  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.79 
 
 
301 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
305 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.44 
 
 
305 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  50.54 
 
 
293 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.24 
 
 
300 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
300 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
300 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.61 
 
 
304 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  53.87 
 
 
304 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 
301 aa  291  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.24 
 
 
300 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.64 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  53.9 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.67 
 
 
379 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  53.55 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  54.01 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  54.01 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  54.01 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  60.35 
 
 
379 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.35 
 
 
379 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  54.38 
 
 
300 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  54.01 
 
 
300 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  54.01 
 
 
300 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  54.01 
 
 
300 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
386 aa  269  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 
376 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161422  normal  0.279284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
310 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
310 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  63.47 
 
 
373 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
377 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  57.56 
 
 
386 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
327 aa  255  6e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
310 aa  250  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.82 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.07 
 
 
363 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.07 
 
 
363 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.874263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
353 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.28935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.91 
 
 
373 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 
320 aa  231  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
325 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 
366 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  0.0491821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6091  cyclic nucleotide-binding protein  55.51 
 
 
366 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
314 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
338 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
340 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
356 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
356 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
342 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
361 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.42 
 
 
369 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.659828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
347 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>