More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1412 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
342 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.97 
 
 
344 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.33 
 
 
343 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.35 
 
 
313 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
303 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
303 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.49 
 
 
307 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.35 
 
 
310 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  55.56 
 
 
310 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
304 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.68 
 
 
323 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145081  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3878  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.11 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
280 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
282 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
280 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.89 
 
 
284 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.37 
 
 
304 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.37 
 
 
304 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.34 
 
 
310 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  39.38 
 
 
300 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
307 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
285 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
285 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  40 
 
 
302 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  48.58 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
300 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
299 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
301 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.56 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.08 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.62 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.3 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
308 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
293 aa  219  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
310 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
332 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
299 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.96 
 
 
495 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
274 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.53 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
302 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.58 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  40.73 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  40.86 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
485 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
494 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.69 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  39.18 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.37 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  40.4 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.4 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.09 
 
 
496 aa  212  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  44.73 
 
 
473 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
347 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
300 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  45.22 
 
 
479 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
283 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
307 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
310 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  36.57 
 
 
307 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
312 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
310 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
307 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  35.47 
 
 
307 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
316 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  36.89 
 
 
307 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.89 
 
 
307 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  38.6 
 
 
302 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  38.6 
 
 
302 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
313 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  38.6 
 
 
302 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  38.6 
 
 
302 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  38.6 
 
 
302 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
313 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
258 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
287 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
306 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
310 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
321 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
306 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
327 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
300 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
331 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
307 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
300 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
300 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
300 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
338 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
296 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>