More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2781 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 450 aa  878    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  67.11 
 
 		 454 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  42.51 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  42.09 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  46.44 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.36 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  41.48 
 
 		 384 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  39.1 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  42.51 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  40.39 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  44.09 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  38.13 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 349 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  39.9 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  40.81 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  39.24 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  35.56 
 
 		 356 aa  193  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  39.23 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  33.83 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  37.16 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  36.1 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  35.71 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  34.53 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  39.39 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  33.99 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  36.04 
 
 		 401 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  37.92 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  37.08 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  34.5 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  34.97 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.11 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  35.53 
 
 		 338 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  35.53 
 
 		 338 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  35.53 
 
 		 338 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  37.11 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  34.96 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  34.11 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.51 
 
 		 371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  31.47 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.85 
 
 		 1033 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.81 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  30.58 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.16 
 
 		 652 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.93 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.9 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  28.5 
 
 		 666 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.83 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  27.79 
 
 		 666 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.01 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 		 369 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.32 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.07 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  30.47 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.57 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.01 
 
 		 369 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  29.16 
 
 		 360 aa  96.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.68 
 
 		 369 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.07 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.56 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.01 
 
 		 369 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 		 369 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.41 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 325 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.76 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 334 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  26.12 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 375 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.52 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.11 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.35 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 		 324 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.54 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  27.12 
 
 		 652 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  28.93 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.13 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.82 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.81 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  28.47 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>