209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2582 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  89.06 
 
 
265 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  61.25 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  52.63 
 
 
256 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  49.08 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  49.43 
 
 
268 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  46.44 
 
 
262 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  47.55 
 
 
250 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  45.83 
 
 
267 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  44.29 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  50.61 
 
 
249 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.75 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  43.23 
 
 
250 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 
251 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
248 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  39.62 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  43.49 
 
 
252 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  42.54 
 
 
257 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.25 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  41.04 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  41.9 
 
 
273 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  41.42 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  38.52 
 
 
259 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 
253 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
246 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 
256 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
256 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  31.25 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  28.74 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 
244 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
240 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.35 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.35 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
244 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.35 
 
 
244 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.35 
 
 
244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 
244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.23 
 
 
244 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.45 
 
 
250 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
263 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
244 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
259 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  30 
 
 
273 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.53 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.56 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30.6 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.92 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29.51 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.35 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.21 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.41 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.42 
 
 
345 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.8 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.64 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25.51 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.66 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
243 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.47 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  27.36 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.41 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.69 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.03 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  26.48 
 
 
447 aa  58.9  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>