115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2498 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  829    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  64.67 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  45.63 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 398 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.87 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  34.65 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  29.54 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  31.96 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  32.8 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 386 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 393 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  30.64 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  29.23 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  29.23 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 453 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  32.98 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.16 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  31.18 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  38.15 
 
 		 222 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  32.15 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  32.53 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  32.53 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  29.51 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 397 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 393 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>