More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1315 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1315  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 1150 aa  2326    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.93 
 
 		 761 aa  273  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 		 646 aa  239  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 658 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 703 aa  234  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.87 
 
 		 661 aa  222  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2395  putative penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 1023 aa  211  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2107  penicillin-binding protein dimerisation domain-contain protein  30 
 
 		 1025 aa  209  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 		 697 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 709 aa  205  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 689 aa  201  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 		 655 aa  188  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  34.43 
 
 		 701 aa  188  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  27.94 
 
 		 724 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  26.69 
 
 		 670 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  26.99 
 
 		 716 aa  184  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 		 764 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  28.15 
 
 		 669 aa  175  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 636 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.4 
 
 		 647 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.82 
 
 		 619 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 617 aa  164  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 609 aa  164  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.33 
 
 		 645 aa  163  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 643 aa  163  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 		 639 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 		 691 aa  160  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  35.26 
 
 		 600 aa  160  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  26.72 
 
 		 697 aa  159  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  33.69 
 
 		 700 aa  158  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  25.29 
 
 		 729 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 557 aa  157  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 605 aa  157  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.73 
 
 		 640 aa  156  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 648 aa  156  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  33.43 
 
 		 669 aa  156  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.23 
 
 		 692 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  25.67 
 
 		 708 aa  154  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  25.86 
 
 		 686 aa  154  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 		 640 aa  154  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 		 642 aa  153  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 588 aa  152  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 596 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 557 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 634 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 597 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 765 aa  149  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 618 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 618 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 618 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.01 
 
 		 647 aa  148  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 		 618 aa  148  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 681 aa  147  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 610 aa  146  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 648 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  28.81 
 
 		 634 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 648 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 		 605 aa  145  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 		 716 aa  145  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 618 aa  144  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 618 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 618 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 		 689 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 		 618 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 618 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 628 aa  144  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 615 aa  143  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 648 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.79 
 
 		 646 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 600 aa  142  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  31.68 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  32.02 
 
 		 617 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 597 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 647 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 760 aa  140  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 640 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 		 681 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 636 aa  139  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 610 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 		 617 aa  138  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 		 626 aa  138  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 		 624 aa  138  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.71 
 
 		 574 aa  138  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 		 595 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.43 
 
 		 615 aa  136  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 671 aa  136  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.14 
 
 		 612 aa  135  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 		 608 aa  136  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 607 aa  136  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 		 641 aa  136  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 		 625 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 670 aa  134  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 703 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 627 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 644 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 618 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>