More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3356 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1209  short chain dehydrogenase  68.89 
 
 
270 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4362  short chain dehydrogenase  68.05 
 
 
270 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0228985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1470  short chain dehydrogenase  65.67 
 
 
271 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
264 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  46.39 
 
 
258 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  46.77 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  46.77 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  46.77 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47060  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 
259 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  45.86 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1584  short chain dehydrogenase  45.86 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6247  short chain dehydrogenase  45.86 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893931  normal  0.68092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4060  short chain dehydrogenase  47.55 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2387  short chain dehydrogenase  46.18 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2216  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 
258 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
275 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
291 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.91 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.91 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
291 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
291 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
276 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
291 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
291 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
291 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
268 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
279 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  37.11 
 
 
275 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
268 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  34 
 
 
847 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
314 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
306 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
277 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  33.2 
 
 
847 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
285 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
276 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
281 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 
278 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
277 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.37 
 
 
274 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.95 
 
 
259 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
287 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
280 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.46 
 
 
272 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
279 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
283 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
276 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
338 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
274 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
277 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
291 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
276 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.89 
 
 
279 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
276 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
275 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 
280 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  98.6  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
280 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
317 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  34.54 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  32.06 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>