More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1452 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1452  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 833 aa  1686    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1602  excinuclease ABC, A subunit  41.61 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  41.41 
 
 		 1896 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  40.02 
 
 		 1855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  38.04 
 
 		 1840 aa  564  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  39.91 
 
 		 1892 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  37.31 
 
 		 1945 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  36.8 
 
 		 1995 aa  552  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  36.86 
 
 		 1959 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 		 1949 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  38.8 
 
 		 2017 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 		 1949 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  37.68 
 
 		 1889 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  47.87 
 
 		 947 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  36.26 
 
 		 1969 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  39.72 
 
 		 827 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 1976 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  36.2 
 
 		 1984 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  37.67 
 
 		 1929 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  36.7 
 
 		 1974 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  38.88 
 
 		 1867 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  36.67 
 
 		 1981 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3637  excinuclease ABC, A subunit  39.4 
 
 		 1847 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  36.26 
 
 		 1971 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  36.43 
 
 		 1941 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  36.18 
 
 		 2005 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  45.9 
 
 		 946 aa  530  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  45.41 
 
 		 946 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  36.81 
 
 		 1957 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  37.09 
 
 		 1967 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  36.85 
 
 		 1964 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  45.13 
 
 		 944 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  48.72 
 
 		 954 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  36.07 
 
 		 1983 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.25 
 
 		 2021 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  45.09 
 
 		 957 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  36.85 
 
 		 1996 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  47.13 
 
 		 941 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.41 
 
 		 1971 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 1964 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  36.3 
 
 		 1997 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 1964 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  36.42 
 
 		 1996 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0275  excinuclease ABC, A subunit  48.18 
 
 		 954 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  48.44 
 
 		 946 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.41 
 
 		 1970 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  35.86 
 
 		 1997 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.41 
 
 		 1970 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0302  excinuclease ABC, A subunit  48.18 
 
 		 954 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.988725 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  36.41 
 
 		 1970 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  46.67 
 
 		 927 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0609  excinuclease ABC, A subunit  45.09 
 
 		 957 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386582  normal  0.048507 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  36.41 
 
 		 1970 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  48.54 
 
 		 954 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  43.98 
 
 		 942 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  37.61 
 
 		 1935 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0779  excinuclease ABC, A subunit  45.1 
 
 		 955 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  44.94 
 
 		 981 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0594  excinuclease ABC, A subunit  45.1 
 
 		 955 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  38.49 
 
 		 853 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0609  excinuclease ABC, A subunit  45.1 
 
 		 955 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  47.59 
 
 		 937 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  43.62 
 
 		 954 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2955  excinuclease ABC, A subunit  44.69 
 
 		 955 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  46.78 
 
 		 955 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  47.88 
 
 		 957 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  44.69 
 
 		 955 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1527  excinuclease ABC, A subunit  44.69 
 
 		 955 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  49.36 
 
 		 940 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  47.41 
 
 		 937 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  46.22 
 
 		 954 aa  515  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  48.18 
 
 		 955 aa  515  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0063  excinuclease ABC, A subunit  44.69 
 
 		 955 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2697  excinuclease ABC, A subunit  47.99 
 
 		 961 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44187  normal  0.109276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  48.05 
 
 		 945 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6109  excinuclease ABC subunit A  48.36 
 
 		 961 aa  512  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2790  excinuclease ABC, A subunit  48.36 
 
 		 961 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735295  normal  0.176229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  47.35 
 
 		 970 aa  512  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2165  excinuclease ABC, A subunit  48.36 
 
 		 961 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  47.96 
 
 		 916 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  45.26 
 
 		 980 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0536  excinuclease ABC, A subunit  44.46 
 
 		 961 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2839  excinuclease ABC, A subunit  47.99 
 
 		 961 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.696224  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  43.36 
 
 		 952 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1905  excinuclease ABC, A subunit  46.86 
 
 		 962 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  37.97 
 
 		 843 aa  512  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2779  excinuclease ABC, A subunit  48.36 
 
 		 961 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  47.22 
 
 		 963 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  47.33 
 
 		 954 aa  507  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06520  excinuclease ABC subunit A  45.64 
 
 		 944 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  47.59 
 
 		 962 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  45.49 
 
 		 961 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  47.33 
 
 		 954 aa  507  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  45.49 
 
 		 939 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  47.59 
 
 		 939 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  46.78 
 
 		 988 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  47.78 
 
 		 916 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1610  excinuclease ABC, A subunit  46.49 
 
 		 965 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  46.15 
 
 		 1019 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0339  excinuclease ABC, A subunit  44.07 
 
 		 1032 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>