More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1602 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  44.39 
 
 		 1855 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  56.32 
 
 		 947 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  44.35 
 
 		 966 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 		 1867 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3697  excinuclease ABC subunit A  45.95 
 
 		 969 aa  777    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3485  excinuclease ABC, A subunit  46.59 
 
 		 913 aa  746    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  41.6 
 
 		 942 aa  679    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  44.75 
 
 		 1892 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  44.7 
 
 		 926 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0844  excinuclease ABC, A subunit  48.62 
 
 		 945 aa  777    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.752183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0226  hypothetical protein  41.51 
 
 		 935 aa  669    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.544357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  44.25 
 
 		 1889 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  61.64 
 
 		 945 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  59.33 
 
 		 946 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  42.55 
 
 		 973 aa  700    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  44.31 
 
 		 2017 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  44.51 
 
 		 946 aa  760    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 1984 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  44.41 
 
 		 921 aa  800    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  45.29 
 
 		 965 aa  734    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  42.97 
 
 		 1895 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1602  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 874 aa  1755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  58.35 
 
 		 937 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  57.35 
 
 		 954 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  41.16 
 
 		 1949 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  59.44 
 
 		 945 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  56.34 
 
 		 927 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  57.41 
 
 		 937 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  58.61 
 
 		 946 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  44.6 
 
 		 1896 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  56.66 
 
 		 947 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  56.85 
 
 		 947 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  41.16 
 
 		 1949 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  57.41 
 
 		 962 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  58.16 
 
 		 954 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  41.42 
 
 		 1945 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  41.66 
 
 		 1941 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  57.04 
 
 		 937 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  55.25 
 
 		 944 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  41.46 
 
 		 1976 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  40.27 
 
 		 1969 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  55.62 
 
 		 942 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  40.61 
 
 		 1981 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  41.48 
 
 		 1964 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  42.01 
 
 		 1996 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3637  excinuclease ABC, A subunit  43.08 
 
 		 1847 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  41.69 
 
 		 1996 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  56.82 
 
 		 916 aa  616  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  56.82 
 
 		 916 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  40.58 
 
 		 1959 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  56.69 
 
 		 944 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  53.72 
 
 		 920 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  56.62 
 
 		 955 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  41.94 
 
 		 1967 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  58.2 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  41.58 
 
 		 2021 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 1964 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1118  excinuclease ABC subunit A  56.32 
 
 		 996 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0632  excinuclease ABC, A subunit  55.57 
 
 		 943 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.198677  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  41.01 
 
 		 1964 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  55.89 
 
 		 948 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  54.48 
 
 		 942 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  41.57 
 
 		 1983 aa  612  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  58.13 
 
 		 957 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  57.41 
 
 		 966 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  40.93 
 
 		 1971 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  55.89 
 
 		 948 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  41.46 
 
 		 1840 aa  611  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  56.3 
 
 		 1019 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  49.17 
 
 		 939 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  56.19 
 
 		 963 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  54.6 
 
 		 950 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  55.88 
 
 		 987 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  56.85 
 
 		 964 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  43.33 
 
 		 1929 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  55.16 
 
 		 939 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  55.51 
 
 		 934 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  55.68 
 
 		 941 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  49.01 
 
 		 939 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  41.36 
 
 		 1974 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  40.08 
 
 		 2005 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  41.42 
 
 		 1997 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  55.08 
 
 		 944 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  53.21 
 
 		 956 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  53.22 
 
 		 958 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  53.04 
 
 		 958 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  53.04 
 
 		 958 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  57.84 
 
 		 946 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  57.09 
 
 		 939 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4720  excinuclease ABC subunit A  55.08 
 
 		 944 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  53.04 
 
 		 958 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  55.43 
 
 		 973 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  55.8 
 
 		 942 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  56.35 
 
 		 947 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  41.01 
 
 		 1971 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>