106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5288 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  100 
 
 		 610 aa  1244    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.18 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.56 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.42 
 
 		 595 aa  54.3  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.97 
 
 		 712 aa  50.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  26.96 
 
 		 580 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  37.29 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  47.06 
 
 		 271 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 		 1141 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0354  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1250  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2216  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  45.1 
 
 		 278 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1537  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.957912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3016  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2900  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0388  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  30.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  24.32 
 
 		 1081 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 331 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 299 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  30.83 
 
 		 1115 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.73 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0754  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 332 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  28.22 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.58 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  36.07 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.66 
 
 		 703 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.86 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  31.31 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  37.78 
 
 		 260 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.63 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5789  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 327 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  26.18 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30 
 
 		 330 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496309  normal  0.0441332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0231  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0207  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 336 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  38.18 
 
 		 333 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.83 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 		 336 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5410  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 330 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.22 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4435  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 332 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.722312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5321  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525379  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5539  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0658459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425373  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  35.38 
 
 		 1165 aa  45.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4733  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  42.31 
 
 		 1195 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.04 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  26.51 
 
 		 464 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.07 
 
 		 616 aa  45.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  44 
 
 		 363 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  35.38 
 
 		 1164 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1144 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 237 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  40.38 
 
 		 1169 aa  44.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1169 aa  44.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 568 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  40.91 
 
 		 250 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  37.74 
 
 		 1134 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  36.07 
 
 		 592 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.33 
 
 		 330 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  42 
 
 		 1222 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  36.07 
 
 		 592 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 262 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0884  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  39.13 
 
 		 360 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.892732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 262 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  40 
 
 		 266 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1163 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  36.07 
 
 		 592 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 647 aa  44.3  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 262 aa  44.3  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  26.28 
 
 		 324 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  39.34 
 
 		 571 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1133 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  44.19 
 
 		 281 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3548  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 343 aa  43.9  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  44.19 
 
 		 279 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  40 
 
 		 266 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 571 aa  43.9  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  27.69 
 
 		 1139 aa  43.9  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 336 aa  43.9  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  36.73 
 
 		 571 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  40.91 
 
 		 250 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.37 
 
 		 564 aa  43.9  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  40 
 
 		 266 aa  43.9  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 274 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 228 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0612  oligopeptide transporter ATP-binding component  37.5 
 
 		 324 aa  43.5  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1191 aa  43.5  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 		 1140 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 		 1192 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>