More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1448 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.88 
 
 		 251 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  79.2 
 
 		 256 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  78.1 
 
 		 242 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  76.4 
 
 		 255 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  74.9 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  74.49 
 
 		 248 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  72.59 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  75.72 
 
 		 244 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  72.51 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  71.04 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  72.51 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  72.36 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 		 257 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  72.87 
 
 		 254 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  72.87 
 
 		 254 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  74.49 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  74.59 
 
 		 280 aa  374  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  69.32 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  71.02 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  71.43 
 
 		 247 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  73.55 
 
 		 242 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  72.73 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  69.11 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  71.49 
 
 		 242 aa  361  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  66.27 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.67 
 
 		 274 aa  355  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.13 
 
 		 264 aa  355  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  68.42 
 
 		 250 aa  350  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  66.26 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  65.02 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  65.13 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  60.49 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  61.04 
 
 		 248 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.37 
 
 		 243 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.59 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.92 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.57 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.55 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  60.56 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.75 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61.16 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 253 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.24 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.68 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  58.23 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.84 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.5 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.75 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.75 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  57.37 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.89 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.34 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.51 
 
 		 258 aa  305  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.33 
 
 		 244 aa  304  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.5 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.92 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.5 
 
 		 248 aa  304  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  61.83 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.5 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  59.43 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  59.43 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  59.43 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  59.43 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.67 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.98 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.92 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  61.13 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.98 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  58.87 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.98 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.97 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 284 aa  301  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  57.66 
 
 		 255 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>