More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0868 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  100 
 
 		 351 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  43.9 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  44.05 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  43.38 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  30.93 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  34.43 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.75 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.47 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  30.29 
 
 		 438 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.04 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.27 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  25.82 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.29 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  28.75 
 
 		 480 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.9 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  28.96 
 
 		 426 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.25 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.38 
 
 		 438 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.7 
 
 		 440 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.28 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  29.74 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.63 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  27.05 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.74 
 
 		 433 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.57 
 
 		 445 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.86 
 
 		 568 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  26.18 
 
 		 446 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.32 
 
 		 426 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.27 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.53 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  26.17 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.34 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.85 
 
 		 431 aa  85.9  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.33 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  30.13 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.03 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.11 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.83 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  29.72 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.66 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  29.4 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.4 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  46.23 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  31.44 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.4 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.4 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.87 
 
 		 1005 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.14 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  30.02 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.43 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.75 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  43.86 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  29.26 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  30.21 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  26.67 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.26 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  28.96 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  40 
 
 		 512 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.2 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.32 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.35 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.29 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.26 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  43.48 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  31.09 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  26.64 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.33 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.47 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.45 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  27.2 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.17 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.76 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  29.58 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.89 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  30.88 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  37.56 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  28.46 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  28.83 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  29.34 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  39.31 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.37 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  27.5 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  34.1 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  36 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  25 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  31.69 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.5 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  31.25 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.46 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.46 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  28.8 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.27 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.85 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.46 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.1 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.51 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>