More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0343 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 329 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  73.2 
 
 		 293 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  65.74 
 
 		 290 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  64.36 
 
 		 288 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  64.36 
 
 		 288 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  64.36 
 
 		 288 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  63.85 
 
 		 300 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  65.29 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  61.03 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  65.72 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  58.42 
 
 		 291 aa  322  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  61.29 
 
 		 307 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  58.99 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  59.93 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  57.24 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.2 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  60.43 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  56.84 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  58.06 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  58.93 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  57.54 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  54.85 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  54.11 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  55.4 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  60.36 
 
 		 285 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  56.51 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  55.02 
 
 		 303 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  52.32 
 
 		 308 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  50.67 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  54.29 
 
 		 581 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.63 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  51.42 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  50.87 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  51.41 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  52.01 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  49.1 
 
 		 285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  39.75 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.96 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  41.9 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.4 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  43.6 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.48 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.12 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.23 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  40.23 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.64 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.02 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43.23 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.63 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.55 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.06 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  40.45 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  41.25 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.48 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.36 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  39.82 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.64 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 388 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.67 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.46 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.86 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.18 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.39 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  41.15 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.12 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  37.8 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.65 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  40.27 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.45 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.58 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  34.46 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.87 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>