More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1616 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  87.58 
 
 
156 aa  278  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  86.45 
 
 
157 aa  276  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  83.66 
 
 
154 aa  265  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  83.66 
 
 
158 aa  263  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  82.35 
 
 
155 aa  259  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  78.43 
 
 
154 aa  250  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  74.34 
 
 
156 aa  228  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
156 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 
175 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  57.52 
 
 
175 aa  189  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  58.78 
 
 
213 aa  186  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  56.86 
 
 
175 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 
161 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 
169 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 
161 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 
229 aa  183  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  55.92 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 
202 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  55.92 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  55.92 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  55.92 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  59.21 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  55.92 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 
175 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 
153 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  52.67 
 
 
153 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
159 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
158 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
153 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
162 aa  153  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
177 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
152 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
152 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
152 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
152 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
147 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
152 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
153 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
166 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.71 
 
 
152 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  47.37 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
155 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
155 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  46.05 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  46.05 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  46.05 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
181 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
161 aa  143  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 
161 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
164 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 
161 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
161 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
157 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
159 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
154 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.03 
 
 
159 aa  135  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
161 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
165 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46.05 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
155 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
152 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.71 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
154 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
159 aa  133  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 
172 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
156 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>