220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3366 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  95.8 
 
 		 262 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  95.8 
 
 		 262 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  67.83 
 
 		 258 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.45 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  31.7 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.06 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  33.5 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.06 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.2 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  31.11 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  30.48 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  26.95 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.23 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  27.98 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  27.31 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  27.31 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  29.55 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  28.23 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.61 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.38 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.88 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.69 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.85 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.51 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.29 
 
 		 281 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  27.97 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.3 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  29.84 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.29 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  30.38 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  26.55 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  29.03 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.52 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.76 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  26.51 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  29.96 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  29.83 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  26.95 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  27.73 
 
 		 339 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  25.1 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  27.34 
 
 		 339 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25.78 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  27.8 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.44 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.44 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  29.41 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.41 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  29.95 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25.78 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.34 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  28.03 
 
 		 341 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.05 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.36 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  28.03 
 
 		 341 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  27.92 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  29.49 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  32.45 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  32.45 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  28.89 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  28.89 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  27.96 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  28.89 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.89 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  28.89 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  27.6 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.89 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>