More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1795 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1795  putative multidrug resistance protein  100 
 
 
191 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  32.81 
 
 
412 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  35.47 
 
 
411 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.95 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  34.44 
 
 
387 aa  77.8  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  34.13 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
387 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  34.23 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
397 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
397 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  33.55 
 
 
406 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
398 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34 
 
 
398 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
398 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
425 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  34.93 
 
 
539 aa  71.2  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  31.74 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  30.57 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.06 
 
 
514 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.51 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 
529 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 
516 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  31.36 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  33.33 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  33.56 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
423 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.86 
 
 
387 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  28.25 
 
 
416 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
397 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  30.57 
 
 
526 aa  68.2  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
399 aa  67.8  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  35.2 
 
 
516 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.58 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.73 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 
513 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  30.43 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
408 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.49 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
399 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.39 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
415 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.94 
 
 
526 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.78 
 
 
416 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.24 
 
 
386 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
381 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  33.57 
 
 
399 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.5 
 
 
416 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.99 
 
 
396 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
381 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.76 
 
 
405 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  28.99 
 
 
409 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  29.59 
 
 
420 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.78 
 
 
381 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.39 
 
 
381 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.78 
 
 
388 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  29.27 
 
 
444 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.78 
 
 
388 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
565 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 
411 aa  63.2  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
410 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 
521 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.75 
 
 
509 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  29.53 
 
 
406 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
615 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.94 
 
 
504 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  26.11 
 
 
561 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.39 
 
 
381 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
396 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.75 
 
 
509 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 
532 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 
702 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
381 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.11 
 
 
511 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  34.23 
 
 
406 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.23 
 
 
406 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
497 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.86 
 
 
431 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.58 
 
 
517 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
391 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
406 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 
513 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.71 
 
 
387 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  30.57 
 
 
397 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>