More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1594 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 354 aa  674    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  62.5 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  62.79 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  61.14 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  64.52 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  54.93 
 
 		 360 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  56.25 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  56.55 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  53.13 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  30.63 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.79 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  30.46 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 334 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  30.81 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  29.74 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  33.18 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  26.54 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  32.86 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  32.86 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  30.43 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  30.43 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  30.43 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  30.43 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  29.87 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.95 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.24 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  28.82 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  29.17 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  33.09 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.77 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  31.31 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.77 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.29 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.77 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.23 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.49 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  28.57 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>