More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0939 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 437 aa  891    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  73.33 
 
 		 438 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 437 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  63.78 
 
 		 441 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 445 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 442 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 443 aa  564  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 		 442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 451 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  64.16 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 444 aa  546  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 452 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 436 aa  392  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 576 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  58.22 
 
 		 575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 578 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 570 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 571 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 579 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 569 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 584 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 571 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 569 aa  279  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 580 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 580 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 571 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 569 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 573 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 580 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 571 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 570 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 570 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 570 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 570 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 571 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 573 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 571 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 585 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 576 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>