More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0827 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.71 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.45 
 
 		 227 aa  287  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.44 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.35 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.55 
 
 		 220 aa  277  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.09 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.43 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.09 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.25 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.89 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.13 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.45 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.68 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.63 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  64.18 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.56 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.43 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.56 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.84 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.85 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.37 
 
 		 232 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3006  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.2 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 221 aa  255  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.09 
 
 		 223 aa  254  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.45 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4340  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.8 
 
 		 227 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.53 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.74 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.71 
 
 		 230 aa  247  9e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.79 
 
 		 224 aa  243  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1198  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.65 
 
 		 227 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00622607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.5 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.34 
 
 		 230 aa  234  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.87 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.06 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1614  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.26 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 217 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.56 
 
 		 214 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.58 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.98 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.05 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.22 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.91 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.79 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 225 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.59 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.6 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.49 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.95 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.07 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.34 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.21 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.35 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.36 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>