More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2900 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
347 aa  712    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  66.28 
 
 
343 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  65.4 
 
 
343 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  62.14 
 
 
350 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  63.2 
 
 
344 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  65.15 
 
 
348 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  60.12 
 
 
352 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  67.1 
 
 
349 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  61.67 
 
 
350 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  64.08 
 
 
337 aa  424  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  61.59 
 
 
349 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  69.05 
 
 
340 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  62.91 
 
 
341 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  61.82 
 
 
341 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  65.1 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  60.65 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  57.88 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  56.89 
 
 
341 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  62.91 
 
 
350 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  58.52 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  60.18 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  56.98 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  56.61 
 
 
354 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  59.37 
 
 
354 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  56.98 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  56.4 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  60.4 
 
 
453 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  57.89 
 
 
347 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  60.4 
 
 
456 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  60.4 
 
 
444 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  59.36 
 
 
350 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  57.73 
 
 
346 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  59.7 
 
 
347 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 
346 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  62.88 
 
 
347 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  58.95 
 
 
347 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  56.74 
 
 
345 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
336 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  56.31 
 
 
364 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  53.22 
 
 
308 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  51.19 
 
 
307 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  48.33 
 
 
356 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  46.6 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  47.46 
 
 
305 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  46.46 
 
 
296 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  47.12 
 
 
304 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
308 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
293 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.6 
 
 
299 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.38 
 
 
302 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
298 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.01 
 
 
296 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  33.8 
 
 
306 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  33.1 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
293 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
296 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
296 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
296 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
305 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
305 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.28 
 
 
494 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
312 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.61 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>