More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2593 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  55.05 
 
 
322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
358 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  48 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  57 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
163 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  52.29 
 
 
381 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56 
 
 
337 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  50.38 
 
 
171 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  59.62 
 
 
323 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  52.38 
 
 
324 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  53.64 
 
 
342 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
335 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
264 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
360 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
360 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
212 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.12 
 
 
206 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
242 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
242 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
265 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.15 
 
 
167 aa  117  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.78 
 
 
277 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  58.89 
 
 
342 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  58.89 
 
 
341 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
270 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
211 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  49.11 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
211 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  49.57 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
199 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
211 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  54.21 
 
 
321 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.47 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  34.78 
 
 
277 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  34.78 
 
 
277 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.67 
 
 
263 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  58.76 
 
 
265 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  65 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
311 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  57.3 
 
 
342 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  49.12 
 
 
227 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
342 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
281 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
246 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
259 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  34.24 
 
 
277 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
335 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
266 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  37.04 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.47 
 
 
367 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
260 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
142 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
262 aa  114  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
333 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.04 
 
 
286 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
332 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
367 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.31 
 
 
324 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  56.99 
 
 
293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  55 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.83 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
282 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  57.3 
 
 
333 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
285 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.14 
 
 
239 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
124 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
278 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
142 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
144 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40 
 
 
280 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  55.45 
 
 
267 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  58.06 
 
 
240 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  40 
 
 
280 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50.41 
 
 
214 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40 
 
 
280 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
243 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  52.48 
 
 
314 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  50.39 
 
 
258 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.05 
 
 
238 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  56.25 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
249 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
283 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  56.18 
 
 
325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  49.46 
 
 
281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
424 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  47.54 
 
 
371 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  50.44 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>