94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2030 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  66.67 
 
 
149 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  45.22 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
113 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  35.37 
 
 
121 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  33.04 
 
 
133 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  33.05 
 
 
129 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  37.37 
 
 
112 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
132 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  33.33 
 
 
123 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  32.5 
 
 
102 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 
111 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 
128 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 
110 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  36.27 
 
 
132 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
121 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  28.24 
 
 
110 aa  51.2  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  31.11 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 
126 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  37.21 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  30.86 
 
 
109 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  32.97 
 
 
110 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 
102 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  28.72 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 
111 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  35.48 
 
 
109 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  28.85 
 
 
127 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  31.25 
 
 
110 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
110 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
110 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  34.15 
 
 
108 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
110 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
111 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 
120 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
110 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
91 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 
109 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
108 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  26.51 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  30.86 
 
 
112 aa  44.7  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 
111 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 
135 aa  44.3  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  28.75 
 
 
110 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
110 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  32.91 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  30 
 
 
91 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  30 
 
 
91 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 
93 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  28.75 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  28.75 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  32.14 
 
 
92 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 
92 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  28.75 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  28.75 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  28.72 
 
 
112 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  27.5 
 
 
89 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  28.16 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  30.53 
 
 
126 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
108 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 
111 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 
110 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 
110 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  30.19 
 
 
143 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  30.49 
 
 
109 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  27.5 
 
 
91 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 
106 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  32.14 
 
 
92 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 
86 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  30.67 
 
 
133 aa  41.2  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  31.65 
 
 
109 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 
86 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  31.65 
 
 
110 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>