62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1094 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  52.42 
 
 
368 aa  141  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  56.64 
 
 
364 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  40.41 
 
 
345 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  43.48 
 
 
354 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  41.46 
 
 
347 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  43.09 
 
 
361 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  41.07 
 
 
343 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  38.94 
 
 
343 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  42.16 
 
 
358 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  40.71 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  41.59 
 
 
348 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  40.14 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  37.84 
 
 
358 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  36.44 
 
 
360 aa  91.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  39.66 
 
 
350 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  38.53 
 
 
347 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  43.14 
 
 
353 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  38.26 
 
 
351 aa  85.5  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  31.29 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  38.24 
 
 
382 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  33.1 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  34.91 
 
 
353 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  34.17 
 
 
361 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  34.91 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  31.25 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.5 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  28.7 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.72 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  37.61 
 
 
354 aa  67.8  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.9 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  37.18 
 
 
381 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  33.67 
 
 
368 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  22.3 
 
 
344 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 
349 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  34.62 
 
 
381 aa  58.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  25.2 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  27.03 
 
 
360 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.25 
 
 
339 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.68 
 
 
341 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.98 
 
 
388 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  31.53 
 
 
387 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  31.53 
 
 
387 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  35.56 
 
 
389 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  30.17 
 
 
351 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  32.58 
 
 
378 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  37.84 
 
 
378 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  25 
 
 
335 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  37.84 
 
 
378 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.32 
 
 
338 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.72 
 
 
389 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  23.24 
 
 
340 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  28.57 
 
 
349 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  28.97 
 
 
365 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  27.7 
 
 
341 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>