223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1704 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  48.94 
 
 
193 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  48.66 
 
 
196 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  47.34 
 
 
196 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  47.87 
 
 
196 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  49.48 
 
 
198 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  51.09 
 
 
191 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  48.37 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  46.84 
 
 
192 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  48.42 
 
 
198 aa  160  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  45.83 
 
 
192 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  49.17 
 
 
193 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  44.51 
 
 
209 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  45.36 
 
 
204 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  45.36 
 
 
204 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  45.36 
 
 
204 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  45.65 
 
 
182 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  45.99 
 
 
187 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  40.93 
 
 
225 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  45.79 
 
 
191 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  42.31 
 
 
204 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  41.53 
 
 
202 aa  141  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  48.65 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  46.45 
 
 
183 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  41.8 
 
 
190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  37.36 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  34.97 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.79 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  34.04 
 
 
187 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  32.97 
 
 
186 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  33.7 
 
 
187 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
184 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  36.63 
 
 
188 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  32.42 
 
 
187 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  38.17 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  29.12 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  36.52 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  26.63 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  35.48 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  33.68 
 
 
237 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  34.22 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  33.51 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  32.8 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  33.68 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  27.42 
 
 
198 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  29.83 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  29.83 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.06 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  29.83 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.94 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  32.8 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  28.37 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.22 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.65 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  28.26 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  31.87 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  30.37 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  33.71 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  28.33 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  29.51 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  32.37 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  32.37 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  29.44 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  30.69 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  30.27 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  33.53 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  35.1 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  31.77 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  29.73 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  29.73 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  35.1 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.73 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  29.28 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  35.96 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  32.42 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  28.44 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  31.28 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  31.72 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  32.26 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  31.28 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  31.72 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  32.04 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  28.89 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  28.89 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>