More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1367 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  57.83 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  57.51 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  58.95 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  56.96 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  52.46 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  52.46 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  55.33 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  52.05 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  55.02 
 
 		 249 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  54.94 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.8 
 
 		 283 aa  220  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  44.21 
 
 		 912 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  40.99 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  41.81 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.85 
 
 		 323 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.34 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  43.84 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  41.23 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.59 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  46.01 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  50.45 
 
 		 522 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 327 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 583 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  40.79 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.98 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.2 
 
 		 318 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  42.06 
 
 		 912 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  41.2 
 
 		 906 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  38.14 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 305 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  40.41 
 
 		 346 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  41.41 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  43.72 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.2 
 
 		 906 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.72 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 		 576 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  41.2 
 
 		 906 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  41.03 
 
 		 906 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 589 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  41.2 
 
 		 912 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  40.62 
 
 		 323 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40 
 
 		 346 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  41.23 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  41.23 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  41.23 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  41.41 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  41.23 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  41.2 
 
 		 912 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.74 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  40.62 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  41.12 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  45.58 
 
 		 354 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  40.79 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  41.89 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  45.91 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  39.26 
 
 		 914 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  40.25 
 
 		 922 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  40.34 
 
 		 917 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  43.84 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  41.63 
 
 		 909 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  42.08 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39.3 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  42.22 
 
 		 691 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 317 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  41.94 
 
 		 667 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 585 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  39.48 
 
 		 911 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>